• El estudio, liderado por AZTI junto con la Universidad del País Vasco, el ICM-CSIC y la Universidad Técnica de Kaiserslautern-Landau (Alemania), publica en Scientific Data el primer catálogo genético de los sedimentos estuarinos.
  • El trabajo identifica más de 108 millones de genes y casi 500 genomas microbianos, abriendo nuevas vías para comprender el papel de los microorganismos en la salud ambiental y el cambio climático.

Pasaia, 10 de diciembre de 2025. Un equipo internacional de investigación, liderado por el centro tecnológico AZTI, ha elaborado el primer catálogo genético de los sedimentos estuarinos de la costa vasca. Representa un recurso científico sin precedentes que ofrece una mirada detallada a la biodiversidad microbiana que habita en estos ecosistemas. El trabajo, titulado The Basque Coast Estuarine Sediment Gene Catalogue, se ha publicado en la revista científica Scientific Data del grupo Springer Nature.

Se trata del primer esfuerzo sistemático para caracterizar genéticamente los hábitats estuarinos mediante técnicas de metagenómica, ampliando el conocimiento generado por grandes iniciativas internacionales como las expediciones TARA Oceans y Malaspina ,en la que también participó AZTI. Con este avance, el País Vasco se incorpora al mapa global de la genómica ambiental marina, aportando una referencia clave sobre ecosistemas costeros templados.

El estudio analiza 92 muestras de sedimentos procedentes de los doce estuarios del litoral vasco, recolectadas entre 2013 y 2020 dentro de la Red de Seguimiento Ambiental del País Vasco. Mediante técnicas de metagenómica, el equipo ha identificado más de 108 millones de genes únicos y ha reconstruido 471 genomas microbianos de alta y media calidad, pertenecientes a bacterias, arqueas, eucariotas y virus.

“Este catálogo genético nos permite explorar cómo los microorganismos sostienen el funcionamiento de los ecosistemas estuarinos y cómo responden a presiones humanas como la contaminación o el cambio climático”, explica Ion L. Abad-Recio, investigador de AZTI y autor principal del estudio. “También abre la puerta a aplicaciones biotecnológicas innovadoras, por ejemplo, en bioremediación o en la búsqueda de genes con potencial industrial”.

Una herramienta para proteger y restaurar los ecosistemas costeros

Más allá de su valor científico, el catálogo constituye una herramienta estratégica para la gestión ambiental y el aprovechamiento sostenible de los ecosistemas costeros. La información genética que reúne permitirá identificar marcadores asociados a contaminación o pérdida de calidad ecológica, fortalecer los modelos de monitoreo ambiental basados en ADN y respaldar políticas de conservación, restauración y manejo costero.

Asimismo, este recurso ofrece una base sólida para la bioprospección y biotecnología, facilitando la detección de genes con potencial de aplicación en sectores como la energía azul, la acuicultura o agricultura sostenible, o la industria alimentaria.

Entre sus principales aplicaciones prácticas destacan el desarrollo de índices de estado ecológico basados en ADN, la vigilancia y bioseguridad portuaria mediante la detección temprana de especies exóticas o patógenos, la gestión ambiental de dragados y vertidos, el monitoreo del carbono azul en estuarios (MRV: medición, reporte y verificación) y la bioremediación dirigida.

Un ecosistema esencial y poco conocido

Los estuarios son zonas de transición entre los ambientes marinos, fluviales y terrestres. En ellos se reciclan nutrientes, se eliminan contaminantes y se acumula carbono orgánico, por lo que desempeñan un papel clave en la regulación climática. Sin embargo, su biodiversidad microbiana sigue siendo en gran parte desconocida.

Gracias a la secuenciación masiva de 3,35 terabases de ADN ambiental, el catálogo ofrece un mapa sin precedentes de la vida microscópica que sostiene estos hábitats. Los datos permiten identificar funciones ecológicas clave y genes indicadores de perturbaciones ambientales, abriendo la posibilidad de mejorar los sistemas de monitoreo biológico y de gestión costera.

Ciencia abierta al servicio del conocimiento

Fiel al principio de ciencia abierta, todo el material generado, incluyendo secuencias, anotaciones funcionales y taxonómicas, y los genomas reconstruidos, está disponible en repositorios públicos (ENA y BioStudies), para que la comunidad científica pueda reutilizarlo en investigaciones futuras.

“La disponibilidad pública de este recurso facilitará comparaciones con otros ecosistemas costeros del mundo y contribuirá a desarrollar herramientas para la evaluación ambiental basada en ADN”, destaca Anders Lanzén, Investigador principal del proyecto en AZTI e IKERBASQUE Research Associate Professor.

Un trabajo colaborativo internacional

El proyecto ha sido desarrollado por AZTI, la Universidad del País Vasco (UPV/EHU), la Rheinland-Pfalz Technische Universität Kaiserslautern-Landau (Alemania), el Instituto de Ciencias del Mar (ICM-CSIC) y IKERBASQUE, con el apoyo del Gobierno español, la Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) y el programa Horizon Europe.

Esta iniciativa refuerza el liderazgo del País Vasco en el ámbito de la ecología marina y la genómica ambiental, aportando datos de referencia sobre la biodiversidad de los fondos estuarinos y su contribución al ciclo global del carbono.

Artículo científico:

  • Abad-Recio, I. L., Rubel, V., Filker, S., Garate, L., Stoeck, T., Logares, R., … Lanzén, A. (2025). The Basque Coast Estuarine Sediment Gene Catalogue. Scientific Data, 12, Article 1909. https://doi.org/10.1038/s41597-025-06163-6

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